Arkæologiske udgravninger vidner om palæo-inuit aktivitet i området – særligt omkring den store sommerboplads Aasivissuit.
Billeder og avisudklip fortæller stedets historie som amerikansk base. Lufthavnen blev grundlagt af amerikanerne under 2. verdenskrig, som mellemlandingsstation for militærfly, der skulle flyve den lange vej fra USA til Europa. Senere, under den Kolde Krig, var Kangerlussuaq forsyningslufthavn for de amerikanske DYE radarstationer på Indlandsisen. Fra Kangerlussuaq kunne store Hercules-fly flyve olie og andet ud til de bemandede DYE stationer, der indgik i det amerikanske missilforsvar.